По действующему порядку определения категории годности мобилизованные граждане по своему статусу приравниваются к военнослужащим, проходящим службу по контракту. Поэтому при освидетельствовании в воинской части медицинская комиссия обоснованно применяет графу III расписания болезней (приложение к постановлению о военно-врачебной экспертизе), а не графы, предназначенные для призывников или ранее не служивших граждан, проходящих сборы.
Графы I и II используются для тех, кто поступает на военную службу впервые по призыву, для граждан, ранее не служивших и призванных на сборы, а также при первичной постановке на воинский учёт. Поскольку вы уже находитесь в статусе военнослужащего в составе воинской части (независимо от того, что предварительное освидетельствование в военкомате при мобилизации могло быть неполным), применяется именно графа III — как для действующих военнослужащих по контракту.
Вопрос о том, было ли корректно проведено освидетельствование при самой мобилизации, и насколько правомерно применение той или иной графы в вашем конкретном случае, имеет существенную правовую составляющую. Рекомендую наряду с медицинским освидетельствованием получить консультацию военного юриста или обратиться с письменным запросом в вышестоящую военно-врачебную комиссию, чтобы уточнить именно нормативно-правовые основания применения графы в вашей ситуации — это позволит защитить ваши интересы при определении категории годности.