Судя по описанной динамике, лечение было проведено своевременно и в достаточном объёме: сначала доксициклин профилактически, затем полноценный курс цефтриаксона внутривенно — это соответствует стандартам терапии боррелиоза, включая неврологические формы. Снижение титра IgM с 89 до 61 — это ожидаемый и хороший признак эффективности лечения, а не показатель неудачи. Дело в том, что IgM-антитела могут циркулировать в крови несколько месяцев после перенесённой инфекции и снижаются постепенно, поэтому их полное исчезновение сразу после курса антибиотиков — редкость.
О резистентности в вашем случае речь не идёт: боррелии не вырабатывают устойчивость к антибиотикам так, как это происходит у бактерий при неправильном или неполном приёме препаратов, а схема лечения у вас была адекватной. Более важно понять, связаны ли текущие неврологические жалобы именно с боррелиозом или имеют другую причину — для этого нужна консультация невролога с осмотром и, возможно, дополнительными исследованиями (МРТ, ЭНМГ по показаниям).
Рекомендую также: — сдать IgG к боррелиям, если этого не делали; — пересдать IgM не ранее чем через 2-3 месяца, чтобы оценить динамику; — сделать общий анализ крови и СРБ для оценки общего воспалительного фона; — при нарастании симптомов (сильное головокружение, слабость в конечностях, нарушение речи) — обратиться на очный приём или вызвать скорую для исключения других неврологических причин.